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9 mars 2008:

Nous avons terminé la partie concernant le master 2 "Physiologie intégrée en conditions extrêmes"

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Version: 1.0
(17 décembre 2007)


Le master : "Physiologie intégrée en conditions extrêmes"


Sommaire :

Présentation du master


        Master 2 Recherche : "Physiologie intégrée en conditions extrêmes"
        Master 2 Professionnel : "Technologies en physiologie et biochimie marine"

Organisation de l'année

S'inscrire au master

Informations diverses



Présentation du master :

Ce master 2 "Physiologie intégrée en conditions extrêmes", qui a succédé au DEA de physiologie "Adaptations et survie en environnements extrêmes" créé en 1989 par le Pr Hervé Barré afin de redynamiser la recherche en physiologie dans le grand Sud Est (universités de Lyon, St Etienne, Marseille), est une formation Bac +5 devenue une spécialité du master Physiologie et Neurosciences de l'université Claude Bernard Lyon 1.

Ce master de physiologie animale regroupe 2 formations, une à visée Recherche (Physiologie intégrée en conditions extrêmes) et une autre plus axée Professionnelle (Technologies en physiologie et biochimie marine), les deux se rapprochant par les méthodes d'analyses issues de la physiologie, mais aussi du fait que le milieu marin est un environnement extrême.


L'une des forces de ce master de physiologie animale est sa diversité : diversité des thèmes abordés, diversité des intervenants, diversité des étudiants.... aussi bien concernant leurs origines géographiques que leur formation initiale. En effet, cette diversité permet la rencontre d'étudiants issus de filières de physiologie, d'écologie,de biologie générale, de médecine, de pharmacie, d'odontologie, de STAPS,  et de vétérinaires ; tous réunis par leur intérêt pour la physiologie et l'écophysiologie en milieux extrêmes.

Afin de vous exposer la diversité des thèmes abordés lors de nos cours, nous vous proposons un petit résumé de chacunes des thématiques ainsi que les noms des intervenants. Ainsi vous vous appercevrez que la cohabitation des 2 formations, professionnelle et recherche, repose sur une forte intéraction, d'où la mise en place d'un tronc commun.


Master 2 Recherche : "Physiologie intégrée en conditions extrêmes" : planning 2007

Master 2 Professionnel : "Technologies en physiologie et biochimie marine" : planning 2007


Lors de ces cours, nous avons pu mieux apprécier le métier des intervenants, qui ont pu nous faire partager leur vision des choses et leur quotidien ; et a donc permis la mise en place de véritables échanges entre les étudiants et les professeurs.

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Thématiques abordés lors du M2R : hypoxie, microgravité, chaud/froid, activité musculaire, jeûne alimentaire, pression, cours complémentaires.

Hypoxie : L'hypoxie est une situation extrême qui résulte d'un manque d'oxygène, qui peut atteindre l'organisme entier (l'altitude), ou un tissu spécifique (ischémie), consécutivement à une pathologie (cancer) ou au milieu de vie (zone intertidale)

A Belmeguenai :
Adaptations de la commande motrice à l'hypoxie
L Bezin : Robustesse cérébrale et hypoxie
J Bodennec : Métabolisme en hypoxie
L Denoroy : Sensibilité et résistance centrale à l'hypoxie
JM Pequignot : Acclimatation ventilatoire à l'hypoxie & Contrôle central des réponses à l'hypoxie
JP Richalet : Adaptations cardiovasculaires à l'altitude

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Microgravité : La microgravité (=apesanteur) est une situation extrême induisant des modifications physiologiques (os, muscles, système cardio vasculaire, systèmes sensoriels). On peut observer la microgravité réelle (station spatiale internationale) ou simulée sur Terre (alitement prolongé pour l'Homme ou suspension pour l'animal)

P Arbeille : Adaptation cardiovasculaires à la microgravité
D Desplanches : Adaptations musculaires, hypokinésie
A Guignandon : Métabolisme osseux, microgravité
M Jamon : Contrôle sensorimoteur, microgravité

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Chaud/Froid : Ces deux situations extrêmes, décrites chez les endothermes (oiseaux, mammifères) et les ectothermes (insectes, amphibiens, reptiles), vont induire des contraintes importantes sur la survie des organismes et leur fitness (exple : population d'oryx d'Arabie). Lors de ces interventions, nous avons pu aborder les différents mécanismes d'acclimatation (sudation vs frisson thermique) ou d'adaptation (régulations hormonales sous jacentes) à ces contraintes, ainsi que les pathologies associées (coup de chaleur vs obésité).

L Bourdon : Adaptation à la chaleur
C Duchamp : Adaptation au froid
S Ostrowski : Adaptations et ajustements fonctionnels des vertébrés au milieu désertique chaud
P Vernon : Adaptation des ectothermes invertébrés au froid
Y Voituron : Adaptation des ectothermes vertébrés au froid

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Activité musculaire : Quand celle ci est intense ou diminuée, les muscles subissent des modifications profondes de leur composition (différence en fibres musculaires, atrophie) et donc de leur fonctionnement (fibres lentes vs fibres rapides). Dans ces situations, l'activité musculaire peut représenter une situation extrême, lors de laquelle une plasticité musculaire survient, impliquant des changements de phénotypes contractiles et métaboliques  (facteurs nerveux, endocriniens, mécaniques, myogéniques).

B Allard : Introduction à la physiologie musculaire
X Bigard : Adaptations musculaires à l'hyperkinésie
D Desplanches : Adaptations musculaires, hypokinésie

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Jeûne alimentaire : Cette situation, régulièrement rencontrée dans le monde animal, est extrême car la gestion des réseves énergétiques d'un organisme va influencer sa survie et sa fitness. Nous avons observé différents animaux, endothermes (manchot adélie) ou ectotherme (le protée), très bien adaptés à ce type de stress et décrit (au moins partiellement) les mécanismes cellulaires ou moléculaires soutendant ces adaptations (hormones orexigènes vs anorexigènes).

F Hervant : Adaptations au jeûne de longue durée
T Raclot : Gestion des réserves énergétiques : survie et reproduction en milieu hostile

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Pression :Essentiellement retrouvée lors de la plongée, cette situation extrême a été surmontée par les mammifères marins (cachalot, phoque de Weddel), par la mise en place de mécanismes (plongée en apné, protection du système nerveux) permettant d'éviter l'ivresse des profondeurs ou le syndrome nerveux des hautes pressions, deux syndrômes pathologiques observés chez l'Homme lors de la plongée.

G Brichon : Plongée des animaux marins
JJ Risso : Hyperbarie

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Ces grandes thématiques ont été complétées par d'autres interventions sur :
- Certains milieux de vie particuliers (forêt, désert, milieu souterrain, confinement) très contraignants aussi bien concernant la communication acoustique (forêt, colonies d'oiseaux), l'accès aux ressources (oxygène, eau, nourriture) ou le comportement des individus (stations polaires)

G Brichon : Plongée des animaux marins
F Hervant : Milieu souterrain
N Mathevon : Communications acoustiques en milieux extrêmes
S Ostrowski : Adaptations et ajustements fonctionnels des vertébrés au milieu désertique chaud
T Raclot : Gestion des réserves énergétiques : survie et reproduction en milieu hostile
C Tafforin : Ethologie des milieux extrêmes


- Certains systèmes physiologiques comme le système immunitaire et son intéraction avec le système nerveux ou les régulations de la vie cellulaire.
JL Beneytout : Apoptose ou différenciation de cellules leucémiques - Angiogenèse tumorale
D Troutaud : Relation système immunitaire et système neuroendocrinien & Cytokines et gestation


- Le stress oxydant qui induit de nombreux dégâts cellulaires et influence le vieillissement.
A Geloën : Stress oxydant et dysrégulations


- Certaines techniques de biologie moléculaire utilisées en laboratoire (RT PCR, puces à ADN, ...)
J Lachuer : Génomique fonctionnelle


- Les analyses statistiques que l'on doit faire en fonction de nos plan expérimentaux et ce que l'on veut mettre en évidence.
H Burnet : Statistiques


- Les règles qui régissent la science (éthique), la diffusion des connaissances (communication scientifique) ou la recherche d'informations (bibliographie)
H Barré : Communication scientifique & Recherche et éthique
F Cohen Adad : Méthodes documentaires


Ajoutons à toutes ces interventions la mise en place d'ateliers nous permettant de réaliser des analyses d'articles et ainsi d'avoir un avis critique vis à vis des recherches déjà réalisées ... et aussi de prendre contact avec "l'anglais scientifique".
H Barré, L Bezin, C Duchamp, A Geloën, JM Pequignot

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Thématiques abordés lors du M2P : hypoxie, chaud/froid, pression, cours complémentairesproduits d'origine marine, écotoxicité, techniques d'analyse, lipidologie, congrès Merck Santé, projet professionnel.

Hypoxie : L'hypoxie est une situation extrême qui résulte d'un manque d'oxygène, qui peut atteindre l'organisme entier (l'altitude), ou un tissu spécifique (ischémie), consécutivement à une pathologie (cancer) ou au milieu de vie (zone intertidale)

J Bodennec : Métabolisme en hypoxie
JM Pequignot : Acclimatation ventilatoire à l'hypoxie & Contrôle central des réponses à l'hypoxie

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Chaud/Froid : Ces deux situations extrêmes, décrites chez les endothermes (oiseaux, mammifères) et les ectothermes (insectes, amphibiens, reptiles), vont induire des contraintes importantes sur la survie des organismes et leur fitness (exple : population d'oryx d'Arabie). Lors de ces interventions, nous avons pu aborder les différents mécanismes d'acclimatation (sudation vs frisson thermique) ou d'adaptation (régulations hormonales sous jacentes) à ces contraintes, ainsi que les pathologies associées (coup de chaleur vs obésité).


C Duchamp : Adaptation au froid
Y Voituron : Adaptation des ectothermes vertébrés au froid

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Pression : Essentiellement retrouvée lors de la plongée, cette situation extrême a été surmontée par les mammifères marins (cachalot, phoque de Weddel), par la mise en place de mécanismes (plongée en apné, protection du système nerveux) permettant d'éviter l'ivresse des profondeurs ou le syndrome nerveux des hautes pressions, deux syndrômes pathologiques observés chez l'Homme lors de la plongée.

G Brichon : Plongée des animaux marins
JJ Risso : Hyperbarie

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Ces grandes thématiques ont été complétées par d'autres interventions :
- Certains milieux de vie particuliers (forêt, désert, milieu souterrain, confinement) très contraignants aussi bien concernant la communication acoustique (forêt, colonies d'oiseaux), l'accès aux ressources (oxygène, eau, nourriture) ou le comportement des individus (stations polaires)
G Brichon : Plongée des animaux marins
C Tafforin : Ethologie des milieux extrêmes


- Le stress oxydant qui induit de nombreux dégâts cellulaires et influence le vieillissement.
A Geloën : Stress oxydant et dysrégulations


- Certaines techniques de biologie moléculaire utilisées en laboratoire (RT PCR, puces à ADN, ...)
J Lachuer : Génomique fonctionnelle


- Les analyses statistiques que l'on doit faire en fonction de nos plan expérimentaux et ce que l'on veut mettre en évidence.
H Burnet : Statistiques


- Les règles qui régissent la science (éthique), la diffusion des connaissances (communication scientifique) ou la recherche d'informations (bibliographie)
H Barré : Communication scientifique & Recherche et éthique
F Cohen Adad : Méthodes documentaires


Ajoutons à toutes ces interventions la mise en place d'ateliers nous permettant de réaliser des analyses d'articles et ainsi d'avoir un avis critique vis à vis des recherches déjà réalisées ... et aussi de prendre contact avec "l'anglais scientifique".
H Barré, L Bezin, C Duchamp, JM Pequignot

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Ce parcours professionnel possède donc des cours en communs avec la partie recherche. En parallèle, des cours en rapport avec le milieu marin sont dispensés. (produits d'origine marine, écotoxicité, techniques d'analyse, lipidologie, congrès Merck Santé, projet professionnel)

- Pour donner quelques exemples, les produits d'origine marine et leur valorisation ont été étudiés :

N Abdul Malak (BASF): Valorisation des productions marine & réglementation
G Brichon : Produits d'origine marine


- Les thèmes d’écotoxicité et de toxines d’origines marines ont été abordés au cours de cette année.

S Betoulle : Ecotoxicologie
G Brichon : Animaux vénimeux
B Romestand : Peptides antimicrobiens des invertébrés


- En ce qui concerne l’aspect « biochimique » ce master permet de comprendre de nombreuses techniques d’analyse. La plupart de ces cours sont donnés par des professionnels travaillant pour des grands groupes industriels.

L Bezin & A Morales : RT PCR Quantitative
J Favre Bonvin : RMN, spectro de masse et Spectroscopie infrarouge UV
JL Roland : Biologie moléculaire- Protéines recombinantes
B Romestand : Immunotechnologie
B Savary (CAMAG France) : Chromatographie planaire


- D’un point de vue plus théorique c’est la lipidologie qui a été étudiée. Ceci en parallèle avec des travaux pratiques.
J Bodennec & G Brichon


-Durant les enseignements du master il nous a aussi été possible de partir à la rencontre de nombreux professionnels lors d'un congrès Merck Santé où était représenté de nombreux industriels.


- Lors de cette formation, des ateliers ont été mis en place afin de nous permettre de rédiger nos CV et lettres de motivation.

J Bodennec : Projet professionnel


La présentation de notre projet professionnel est une partie essentielle de notre formation, qui va nous permettre, lors d'un oral, de construire un projet d'entreprise, qui sera jugé par des professionnels de la création d'entreprise.


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Organisation de l'année :

Ces cours nous ont été dispensés pendant 6 semaines (début octobre à mi novembre).

Jusqu'aux dates des partiels (début janvier), notre temps disponible est utilisé pour prendre connaissance de nos sujets de stage et réaliser notre bibliographie.

Pour les étudiants en master 2 recherche, un oral (non noté) est mis en place afin de présenter nos sujets de recherche, de recadrer l'étudiant si le sujet n'entre pas dans la thématique du master ou semble impossible à réaliser et de permettre de préparer l'oral de juin (noté).

Enfin, pour tous, le stage commence .... pour 5 - 6 mois, pour pouvoir, au mois de juin, présenter nos résultats dans un rapport et lors d'un oral.

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S'inscrire au master :

Pour s'inscrire à ce master, cliquer sur ce lien

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Informations diverses

Instruction pour la rédaction du mémoire : presentation.doc


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